苏垦农发标志以SKIAD为基本形状，SK为“苏垦”的拼音首字母，IAD为Integration of Agricultural Development（农业一体化发展）的缩写，字母D做图形化处理，环环相扣，紧密交织的链性结构，象征全产业链的发展模式。图形D的中央，保留江苏农垦原有标识三叶草造型，象征企业对农垦文化的继承与延续。
苏垦农发的标准色是绿色和橙色，绿色体现了苏垦农发创造绿色事业、打造绿色文化、奉献绿色健康食品，使经济发展与社会环境、自然环境和谐相处、共同发展。橙色体现了粮食成熟时的颜色也象征企业的蓬勃朝气。同时由绿到黄的过渡也展示了农业生产从种植到收获的完整过程。